Introduction

Dans mon article précédent, j'ai présenté le module IRIStool, qui intègre de manière transparente la bibliothèque pandas pour Python à la base de données IRIS. Je vais maintenant vous expliquer comment utiliser IRIStool pour exploiter InterSystems IRIS comme base pour une recherche sémantique intelligente dans les données de soins de santé au format FHIR.

Cet article décrit ce que j'ai fait pour créer une base de données pour mon autre projet, FHIR Data Explorer. Les deux projets sont candidats au concours InterSystems actuel, alors n'hésitez pas à voter pour eux si vous les trouvez utiles.

Ils sont disponibles sur Open Exchange:

• IRIStool et Data Manager
• FHIR Data Explorer

Dans cet article, nous aborderons les sujets suivants:

• Connexion à la base de données InterSystems IRIS via Python
• Création d'un schéma de base de données compatible FHIR
• Importation de données FHIR au moyen d'intégrations vectorielles pour la recherche sémantique

Aperçu

Cette interface Web est conçue pour faciliter la gestion des tables de recherche de données (Data Lookup Tables) via une page Web conviviale. Elle est particulièrement utile lorsque les valeurs de votre table de recherche sont volumineuses, dynamiques et changeantes. Les utilisateurs finaux peuvent gérer efficacement les données de la table de recherche en fonction de leurs besoins grâce à un accès contrôlé à cette interface Web (autorisations de lecture, d'écriture et de suppression limitées à cette page).

Les données gérées via cette interface peuvent être utilisées de manière transparente pour les règles HealthConnect ou les transformations de données, ce qui élimine le besoin d'une surveillance et d'une gestion manuelles constantes des tables de recherche et permet ainsi un gain de temps considérable.

Remarque:
Si la table de recherche de données classique ne répond pas à vos besoins en matière de mappage, vous pouvez créer une table personnalisée et adapter cette interface Web ainsi que sa classe de support avec un minimum de modifications. Un exemple de code de classe est disponible sur demande.

Bonjour à tous les membres de la communauté!

Beaucoup d'entre vous se souviennent certainement des fonctionnalités NLP disponibles dans IRIS sous le nom iKnow, qui ont été supprimées depuis peu de temps. Mais... Tout a-t-il été supprimé ? NON! Un petit village résiste à la suppression: les index iFind!

Aperçu Je suis ravi d'annoncer la sortie de testcontainers-iris-node, une bibliothèque Node.js qui facilite le lancement de conteneurs InterSystems IRIS temporaires pour l'intégration et les tests E2E. Ce projet vient naturellement compléter la gamme existante d'adaptateurs Testcontainers pour IRIS, notamment testcontainers-iris-python et testcontainers-iris-java.

Pourquoi testcontainers-iris-node? En tant que développeur Node.js travaillant avec InterSystems IRIS, j'ai souvent été confronté à des difficultés lors de la configuration d'environnements de test imitant la production. testcontainers-iris-node résout ce problème en exploitant le framework testcontainers-node pour créer des environnements IRIS isolés à la demande.

Ceci est particulièrement important pour:

• Les tests d'intégration avec les bases de données IRIS
• Les tests de pipelines de données ou de microservices
• L'automatisation des environnements de test dans les pipelines CI

Fonctionnalités

• Lancement d'IRIS dans des conteneurs Docker à l'aide de Testcontainers
• Prise en charge des images et de la configuration Docker personnalisées
• Stratégies d'attente pour s'assurer qu'IRIS est prêt avant le début des tests
• Désinstallation de nettoyage entre les exécutions de tests

Si vous avez jamais observé un véritable artisan, qu'il s'agisse d'un potier transformant de l'argile en chef-d'œuvre ou d'un luthier donnant vie à un morceau de bois brut pour en faire une magnifique guitare, vous savez que la magie ne réside pas dans les matériaux, mais dans le soin, le savoir-faire et le traitement. Je le sais d'expérience : ma guitare électrique faite à la main est une source d'inspiration quotidienne, mais je dois avouer que créer quelque chose de ce genre est un don qui me manque.

Rubrique FAQ InterSystems

Si vous souhaitez générer une erreur personnalisée arbitraire dans un bloc TRY, vous pouvez transmettre une exception avec un throw comme suit. Dans l'exemple suivant, une erreur personnalisée est générée si Stcount est inférieur à 1.

#InterSystems Demo Games

⏯️  Éliminer le gaspillage dans les chaînes d'approvisionnement des soins de santé
 

Entre les rappels de fournitures, les stocks périmés et les dépenses inconsidérées, on estime que 25 milliards de dollars par an sont gaspillés dans les chaînes d'approvisionnement du secteur de la santé. Nous savons à quel point la chaîne d'approvisionnement est cruciale dans le secteur de la santé ; nous savons donc que ce problème mérite d'être résolu ! À quoi pourrait ressembler une solution ? Regardez et découvrez-la !

Rubrique FAQ InterSystems

Par défaut, l'ordre des colonnes d'une table est déterminé automatiquement par le système. Pour modifier cet ordre, définissez explicitement l'ordre de chaque propriété à l'aide du mot-clé SqlColumnNumber lors de la définition de la classe.

Exemple :

Property Name As %String [SqlColumnNumber = 2];

Veuillez consulter la documentation ci-dessous.

SqlColumnNumber

Si vous souhaitez modifier le nom de la table SQL, spécifiez SqlTableName. Si vous souhaitez modifier le nom de la colonne (nom du champ), spécifiez SqlFieldName.

Les données sont au cœur de la transformation numérique qui bouleverse le secteur de la santé. Ce changement radical nécessite de nouvelles bases pour gérer les énormes besoins en données des soins de santé modernes.

Le délai de mise sur le marché est crucial pour développer les prochaines avancées thérapeutiques, les connaissances génomiques et les flux de travail cliniques intelligents. Vous devez les mettre en œuvre dès maintenant.

Bonjour, chers membres de notre communauté de développeurs!

Dans l'article d'aujourd'hui, nous allons examiner l'une des dernières fonctionnalités de télésurveillance de nos instances IRIS qui a été ajoutée au produit. Il s'agit de la compatibilité avec OpenTelemetry.

🛠️ Gestion des configurations d'InterSystems API Manager (IAM = Kong Gateway) en CI/CD

🔍 Contexte : configurations d'InterSystems IAM

Dans le cadre de l'intégration d'InterSystems IAM dans un environnement sécurisé et contrôlé, InterSystems IAM repose sur Kong Gateway pour gérer les API exposées. Kong agit comme une API Gateway moderne, capable de gérer l’authentification, la sécurité, la gestion du trafic, les plugins, et bien plus encore.

Si vous migrez d'Oracle vers InterSystems IRIS, comme beaucoup de mes clients, vous risquez de rencontrer des modèles SQL spécifiques à Oracle nécessitant une conversion.

Prenons l'exemple suivant:

SELECT (TO_DATE('2023-05-12','YYYY-MM-DD') - LEVEL + 1) AS gap_date
FROM dual
CONNECT BY LEVEL <= (TO_DATE('2023-05-12','YYYY-MM-DD') - TO_DATE('2023-05-02','YYYY-MM-DD') + 1);

Dans Oracle:

J'ai dû récemment rafraîchir mes connaissances sur le module EMPI de HealthShare et, comme je travaillais depuis quelque temps sur les fonctionnalités de stockage et de recherche vectorielle d'IRIS, j'ai tout naturellement fait le rapprochement.

Pour ceux d'entre vous qui ne connaissent pas bien les fonctionnalités EMPI, voici une brève introduction:

Index patient principal "Enterprise Master Patient Index"

Kong fournit en open source un outil de gestion de ses configurations (écrit en Go), appelé decK (pour declarative Kong)

• Vérifiez que decK reconnaît votre installation Kong Gateway via deck gateway ping

deck gateway ping   
Successfully connected to Kong!
Kong version:  3.4.3.11

• Exporter la configuration de Kong Gateway dans un fichier "kong.yaml" via deck gateway dump

deck gateway dump -o kong.yaml

• Après avoir modifié les adresses IP dans le fichier kong.yaml, afficher les différences via deck gateway diff

Je sais que ceux qui découvrent VS Code, Git, Docker, FHIR et d'autres outils peuvent parfois avoir des difficultés à configurer l'environnement. J'ai donc décidé de rédiger un article qui explique étape par étape l'ensemble du processus de configuration afin de faciliter les premiers pas.

Je vous serais très reconnaissant de bien vouloir laisser un commentaire à la fin de cet article pour me faire savoir si les instructions étaient claires, s'il manquait quelque chose ou si vous avez d'autres suggestions qui pourraient être utiles.

La configuration comprend:

✅ VS Code – Éditeur de code
✅ Git – Système de contrôle de version
✅ Docker – Lancement d'une instance de la communauté IRIS for Health
✅ Extension VS Code REST Client – Pour l'exécution de requêtes API FHIR
✅ Python – Pour l'écriture de scripts basés sur FHIR
✅ Jupyter Notebooks – Pour les tâches liées à l'IA et au FHIR

Avant de commencer: Vérifiez que vous disposiez des privilèges d'administrateur sur votre système.

Outre la lecture du guide, vous pouvez également suivre les étapes décrites dans les vidéos:

Pour Windows

<iframe allowfullscreen="" frameborder="0" height="360" src="https://www.youtube.com/embed/IyvuHbxCwCY" width="640"></iframe>

Bonjour à la communauté,

Vous cherchez un moyen d'intégrer InterSystems IRIS® for Health à votre équipe ? Exploitez tout le potentiel de cette plateforme grâce à ces ressources de formation InterSystems. Grâce à une combinaison de formations en ligne et en présentiel, vous pouvez accompagner différents rôles au sein de votre organisation et préparer votre équipe à la réussite.

Ressources d'intégration pour chaque rôle

Développeurs

Bonjour à la communauté,

Exploitez tout le potentiel d'InterSystems IRIS et accompagnez votre équipe dans son intégration grâce à la gamme complète de ressources de formation InterSystems, disponibles en ligne et en présentiel, adaptées à chaque rôle de votre organisation. Les développeurs, administrateurs système, analystes de données et intégrateurs peuvent rapidement se familiariser avec la solution.

Ressources d'intégration pour chaque rôle

Développeurs

L'indication de requête parallèle augmente les performances de certaines requêtes sur les systèmes multiprocesseurs par le biais du traitement parallèle. L'optimiseur SQL détermine les cas où cela est bénéfique. Sur les systèmes à un seul processeur, cette indication n'a aucun effet.

Le traitement parallèle peut être géré par:

1.  Définition de l'option auto parallel pour l'ensemble du système.
   

2. L'utilisation du mot-clé %PARALLEL dans la clause FROM de certaines requêtes.
   

Le mot clé %PARALLEL est ignoré lorsqu'il est appliqué aux requêtes suivantes:

TLS, qu'est-ce que c'est ?

Rubrique FAQ InterSystems

Les variables globales temporaires stockées dans les bases de données IRISTEMP/CACHETEMP sont utilisées lorsqu'un processus n'a pas besoin de stocker des données indéfiniment, mais requiert les performances élevées des variables globales. Les bases de données IRISTEMP/CACHETEMP ne sont pas journalisées ; leur utilisation ne crée donc pas de fichiers journaux.

Le système utilise les bases de données IRISTEMP/CACHETEMP pour le stockage temporaire et les utilisateurs peuvent y accéder à cette fin.

Depuis l'introduction d'Embedded Python, il y a toujours eu un doute sur ses performances par rapport à ObjectScript et J'en ai discuté à plusieurs reprises avec @Guillaume Rongier , eh bien, profitant du fait que je faisais une petite application pour capturer les données des concours publics en Espagne et pouvoir effectuer des recherches en utilisant les capacités de VectorSearch, j'ai vu l'opportunité de réaliser un petit test.

Données pour le test

En utilisant IRIS 2024.1.2 lorsque je monte la base de données de routine en lecture seule, j'obtiens une erreur lors de l'exécution de requêtes SQL dynamique.

Quelles globales doivent être mappées dans une base de données en lecture-écriture afin de permettre l'écriture des plans d'exécutions ?

Bonjour,

Comme il m'a fallu un certain temps pour comprendre d'où venait le problème, je voudrais partager cette expérience, afin que vous ne tombiez pas dans le même piège.

Je viens de remarquer que si vous nommez votre package "code" (tout en minuscules), dans une classe utilisant du python intégré en utilisant [Language = python], vous aurez l'erreur suivante :

 <THROW> *%Exception.PythonException <PYTHON EXCEPTION> 246 <class 'ModuleNotFoundError'>: No module named 'code.basics'; 'code' is not a package

L'utilisation de Embedded Python lors de la création d'une solution basée sur InterSystems peut ajouter des fonctionnalités très puissantes et approfondies à votre boîte à outils.

J'aimerais partager un exemple de cas d'utilisation que j'ai rencontré : l'activation d'un CDC (Change Data Capture) pour une collection mongoDB - la capture de ces modifications, leur digestion via un flux d'interopérabilité et, pour finir, la mise à jour d'un EMR via une API REST.

InterSystems est à l'avant-garde de la technologie des bases de données depuis sa création, en étant à l'origine d'innovations qui surpassent régulièrement ses concurrents comme Oracle, IBM et Microsoft. En se concentrant sur une conception de noyau efficace et en adoptant une approche sans compromis des performances des données, InterSystems s'est taillé une place de choix dans les applications critiques, garantissant fiabilité, rapidité et évolutivité.

Une histoire d'excellence technique

Dans un environnement conteneurisé, vous pouvez gérer l'heure de votre conteneur via la variable TZ ou via les répertoires /etc/timezone et /etc/localtime :

environment:
      - TZ=Europe/Paris

volumes:
    - "/etc/timezone:/etc/timezone:ro"
    - "/etc/localtime:/etc/localtime:ro"

Vous pouvez retrouver des exemples complets ici :

IRIS Community

IRISHealth_Community

IRIS production

IRISHealth production

Préférez-vous ne pas lire? Regardez la vidéo de démonstration que j'ai créée:

<iframe allowfullscreen="" frameborder="0" height="360" src="https://www.youtube.com/embed/-OwOAHC5b3s" width="640"></iframe>

Lors du dernier concours InterSystems "Bringing Ideas to Reality", j'ai parcouru le portail d'idées à la recherche de problèmes d'interface utilisateur à traiter. 

<iframe allowfullscreen="" frameborder="0" height="360" src="https://www.youtube.com/embed/zw51X1JQhQ0" width="640"></iframe>

Votre mission

Imaginons que vous êtes un espion international qui consacre sa vie à protéger les habitants de notre planète contre les dangers. La mission suivante vous est confiée:

Cher agent IRIS,

Nous sommes désolés d'interrompre vos vacances aux Bahamas, mais notre agent à Londres vient de nous informer qu'une "bombe à explosion retardée" est prête à exploser dans une zone très peuplée de Los Angeles. Selon nos informateurs, la "bombe à explosion retardée" devrait se déclencher à 15h14 aujourd'hui.

Dépêchez-vous, les citoyens comptent sur vous!

Le problème

Traduit du concours d'articles de la communauté espagnole.

Suite au dernier concours de programmation sur OEX j'ai eu une observation surprenante.
Il existait des applications presque exclusives basées sur l'IA en combinaison avec des modules Py précuits.
Mais en creusant plus profondément, tous les exemples utilisaient les mêmes éléments techniques d'IRIS.

Du point de vue d'IRIS, c'était à peu près la même chose que la recherche de texte
ou la recherche d'images ou d'autres motifs.  Cela s'est terminé par des méthodes presque échangeables.